A bandeira municipal foi criada com a Lei nº 920 de 19/12/1968.

As cores da bandeira foram tiradas do 1º e 4º quartel do brasão, que dizem: "A cor azul, representa o céu sereno do Brasil, sob o qual nos abrigamos como pequena partícula do solo pátrio".

A cor vermelha das rosas é a afirmação de fé e amor da doutrina cristã, ou ainda como símbolo da liberdade e da República Federativa usada na Bandeira do Piratini.

A cor prata (também representada pela cor branca), representa o caráter nobre, altivo e pacífico das pessoas de Estrela, através de seus exemplos de serenidade em todas as horas.

Os triângulos que encerram as cores, representam as três facetas do dístico da bandeira do Rio Grande do Sul, que por propostas de um vereador estrelense[carece de fontes?], passou a ser a bandeira oficial do Estado Farroupilha, oriundo da grande revolução: Liberdade, Igualdade e Humanidade.

Ao centro, na parte prata, ou branca, está o brasão do município, como na maioria das bandeiras, arrematando o pavilhão.